南澳城建于明万历四年(公元1576年)。民间流传这是海瑞所测定的位置。
    明朝嘉靖四十四年(公元1565年)，戚继光率兵歼灭了南澳海盗吴干之后，深感此地为闽粤要冲，便提议在此建城，设兵镇守。建议得到闽粤两省官员的支持。翌年，户部主事海瑞前来勘察。在海上眺望南澳，但见三面高山，一面临海，近海处有虎屿、猎屿作天然屏障，不愧是闽粤天险。
    他当即绘了一幅建城图奏请皇帝过目。皇帝命令深谙地理风水之道的国师前去实地勘查。国师到了南澳，看到该处有如“七星赶月”，即将建造的南澳城，圆似满月，城外的狗头山、安仔屏山、大金山、小金山、妈祖庙后大井、妈祖印礁和王公庙后大石，仿佛七颗星赶着这圆形的月。国师极为佩服海瑞所相中的南澳城方位。
    同时，他发现南澳有“金、木、水、火、土”五行之地。而属金的金山又高又大，属木的狗头山比金山小得多，故金克木。国师惊讶地说：“南澳金克木，出一代大官，又出一代大贼!”于是，国师在属土的虎头山上设计建起一个四角亭，来抵制金克木，以免出太大的官和太大的贼。
    万历四年，南澳城终于建成了。也许是巧合吧，清朝时南澳雄杰辈出，共有“七提督八镇台十三协台”。到了民国初期，又出了吴品三、曾伯崇、陈顺等一代名盗。